Di SMK Babussalam, Laboratorium Farmasi tidak hanya berfungsi sebagai ruangan pelengkap, tetapi merupakan jantung dari seluruh kurikulum kejuruan. Di sinilah teori yang didapatkan di kelas diubah menjadi keterampilan nyata (hard skills) yang sangat dibutuhkan di dunia kerja.
Fasilitas Laboratorium Farmasi di SMK Babussalam dirancang untuk mereplikasi lingkungan kerja kefarmasian yang sesungguhnya. Laboratorium ini dilengkapi dengan berbagai peralatan standar, mulai dari timbangan analitik, alat-alat gelas, bahan-bahan kimia farmasi, hingga alat pengujian sediaan, memastikan siswa terbiasa dengan instrumen yang akan mereka temui di apotek, rumah sakit, maupun industri farmasi.